基因组与个体_学术交流
人皮肤元基因组的功能
来源:中心 发布日期:2015-04-14
微生物研究小组读书报告会——人皮肤元基因组的功能
Biogeography and individuality shape function in the human skin metagenome
时间:2015-04-13
地点:综合楼14楼会议室
主讲人:姚姿婷
职称:助理研究员
内容简介:
通过对各异的皮肤部位研究,可了解人体微环境如何影响皮肤微生物群的种类和功能。以前基于分类标记基因所做的研究表明,人皮肤有一个丰富的、多样的微生物群。Julia Segre及同事在这篇论文中报告了利用来自15个美国华盛顿市区健康人士的18个身体部位的样本对健康人皮肤微生物群所做的一项元基因组测序研究。他们所采用的元基因组方法显示了令人吃惊的分类和功能多样性以及部位特异性和个人特征。该研究不仅改进了对细菌、真菌和病毒的全面研究的方法,获得的来自皮肤的样本病毒和真菌相关信息要比来自其他身体部位、包括肠道的样本的信息更丰富;而且分析了一些优势种在菌株水平上的进化多样性。这项工作还生成了由近600万个基因组成的一个参照目录,它可被用来识别皮肤微生物群中目前没有参照基因组的微生物的基因特征。(文献链接doi: 10.1038/nature13786)
图示. 各异的皮肤部位微生物种类及丰度可改变该部位的微环境