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基因组与个体_论文论著
双侧肾透明细胞癌的细胞分子特征
来源:基因组与个体化医学研究中网站心   发布日期:2021-06-08
  20216月,基因组中心肾癌团队在肿瘤学领域Frontiers in Oncology杂志发表题为“Single-cell RNA-seq identification of the cellular molecular characteristics of sporadic bilateral clear cell renal cell carcinoma”的文章。该文章对一例双侧肾癌患者两侧肾脏透明细胞癌分别进行了单细胞转录组测序,捕获了7143个高质量细胞数据进行分析,探讨双侧肾癌的细胞分类和转录组信息。

  双侧肾细胞癌(RCC)是一种罕见的疾病,可分为家族性或偶发性。大多数家族性双侧肾细胞癌的DNA水平发生种系改变。例如,VHL病是由VHL基因的种系突变引起,常导致双侧肾细胞癌的发生。细胞的分子特征可以在RNA水平上表达,特别是在单细胞水平上。本研究利用双侧散发性透明细胞癌的scRNA-seq数据,在单细胞转录组水平上揭示了肿瘤组织不同位置的转录组特征。这一结果为双侧RCC的研究提供了新的见解,并且对指导临床治疗具有重要意义。

  该研究包含左侧肾细胞癌中3575高质量细胞和右侧肾细胞癌中3568个高质量细胞的scRNA-seq数据。分别展示了左右两侧散发性透明细胞癌的细胞亚群。 其中,左侧肾癌包含了15个细胞类群,右侧包含了13个细胞类群(图1)。为双侧RCC细胞生物学和双侧RCC的研究提供了可靠的参考。


图1 散发性双侧ccRCC的单细胞转录组图谱

该文章由玉镇源博士和鲁文浩硕士研究生并列共同第一作者,中心莫曾南教授与程继文教授为该文章的共同通讯作者。

文章链接:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fonc.2021.659251/full

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