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高维单细胞蛋白质组学分析揭示肾肿瘤中免疫细胞和干细胞样细胞的面貌
来源：中心 发布日期：2020-07-13
2020年5月，王秋雁课题组在《Journal of Clinical Laboratory Analysis》发表题为“High-dimensional single-cell proteomics analysis reveals the landscape of immune cells and stem-like cells in renal tumors”的文章。该文章阐述了肾肿瘤具有高度的异质性，肿瘤的异质性在预测治疗效果和对可能受益于特定治疗的患者进行分类方面带来了重大挑战，因此鉴别肿瘤的异质性是临床急需的有效治疗手段。目前，单细胞分析是阐明肿瘤异质性的重要手段，是肿瘤诊断和治疗领域的一个突破，除了单细胞测序外，质谱流式细胞技术也被认为是检测肿瘤异质性的重要手段。利用质谱流式细胞术(cytometry by time-of-flight ，CyTOF)对异质性样品进行高维单细胞蛋白质组学分析，可以对细胞表型进行更准确地观察和分类。本研究旨在建立一种高维单细胞分析方法来检测和分析肾肿瘤的异质性，对肾肿瘤的免疫微环境和肿瘤干细胞的异质性进行了初步研究。
我们收集了8例不同类型肾肿瘤患者的组织样本，包括2例肾嫌色细胞癌、3例肾透明细胞癌、1例乳头状肾细胞癌、1后肾腺瘤和肾盂尿路上皮癌。用28种肿瘤浸润免疫细胞抗体和21种肿瘤干细胞相关抗对单细胞悬液进行染色。用CyTOF检测染色的细胞悬液。根据细胞表型的相似性，肾肿瘤免疫细胞被分为25个亚群(4 个CD4 + T细胞亚群,7个 CD8 + T细胞亚群,1个B细胞亚群,8个巨噬细胞亚群,1个树突状细胞亚群,2个自然杀伤(NK)细胞亚群,1个粒细胞亚群和1个其它细胞亚群)和7肿瘤干细胞样癌细胞亚群(基于波形蛋白、CD326 CD34, CD90、CD13、CD44、和CD47的阳性表达)。图1为本研究的工作流程。不同类型的肾肿瘤具的细胞亚群具有明显不同的特征，利用质谱流式细胞技术可对肾肿瘤免疫细胞亚群进行精细的分群，分析干细胞样细胞标志物在肾肿瘤中的表达。我们的发现为揭示肿瘤的异质性提供了有价值的资源，并可能改善肾肿瘤患者的临床管理。
Figure1. Workflow processing of samples of renal tumors and analytical methods for mass cytometry
我中心王秋雁教授与李天宇副教授为该文章的共同通讯作者，李枝键硕士研究生、胡嘉欣硕士研究生为共同第一作者。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7246380/
